En el BIOMETAL se buscan nuevas tecnologías limpias o la mejoría de un bioproceso ya existente, para remediar sitios contaminados por metales y metaloides, los cuales pueden ser fuentes potenciales de la contaminación de aguas superficiales y acuíferos.
Una de las características comunes de los sitios contaminados por metales, tal como, el drenaje ácido de las minerías (AMD, del inglés acid mine drainages), los fluidos geotérmicos y algunos desechos industriales, es su elevada acidez o alcalinidad.
Éstas características hacen que el uso de la mayoría de los sistemas existentes de biorremediación o bioatenuación no puedan ser aplicables, ya que, en general los microorganismos usualmente utilizados, no están adaptados a tales condiciones extremas.
En el BIOMETAL se realizará la bioprospección de microorganismos acidófilos/alcalófilos, tanto de sitios antrópicamente contaminados (como el AMD en Carnoules, Francia), o naturalmente extremos, como el lago alcalino del volcán Parangueo (Guanajuato, México) y las aguas termales naturalmente contaminadas por metales y metaloides del sitio geotérmico Los Azufres (Michoacán, México), buscando el desarrollo de bioprocesos para la reducción y remoción de las formas mas toxicas del cromo y del arsénico, en condiciones alcalinas y ácidas, respectivamete.